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由於史上空前的大災難「第二次衝擊」突然發生，因而造成人類近半數死亡，世界各地都留下了嚴重破壞的痕跡。經過一段長時間的修生養息之後，大家都認為平靜的日子即將恢復。
一名14歲少年‧碇真嗣被父親叫到了第3新東京市，等待著與父親見面。此時，在他眼前的山林間突然出現了巨大的生物！那是被稱為「使徒」的神秘存在。不久，聯合國軍隊隨即與使徒展開激烈交戰，一旁的真嗣遭到戰鬥的爆風波及，面臨生死存亡的危機，最後幸運地被一個名叫「葛美里」的女子所救。
真嗣搭乘美里的車來到了特務機關NERV本部，並在這裡與相隔10年未見面的父親重逢。然而真嗣的父親‧碇源堂所做的第一件事，卻是讓真嗣看他秘密研發的巨大人型兵器，並強迫真嗣與使徒作戰。這就是真嗣和人造人福音戰士「初號機」的第一次邂逅。
真嗣雖然不願從命，但是當他看到女駕駛綾波零負傷後，終於放棄逃避的念頭，決定出擊。在完全沒有接受訓練的狀況下，首次駕駛EVA初號機的真嗣與使徒陷入了對峙。
背負著全世界命運的14歲少年真嗣，他究竟要如何戰鬥？而隱藏在第二次衝擊中的關鍵字「人類補完計劃」究竟又是什麼？
掌握一切謎題關鍵的碇源堂，在一旁冷眼盯著真嗣的苦戰……
「新世紀福音戰士」（「EVA」）相關商品的總銷售金額超過1500億日幣，自首次播出迄今12年餘，人氣未曾衰減。不僅如此，它還持續開拓出新的影迷，堪稱為怪獸級作品。
1995年10月，「EVA」以全26話的電視版動畫型態在東京電視台開始播出。14歲少年搭乘巨大人型兵器福音戰士，與不斷來襲的敵人戰鬥…。故事首先是從這種被廣泛認知的傳統機器人動畫路線開始發展。
但是，沒多久觀眾便發現其中的差異，並開始產生了騷動。從螢幕傳來的「EVA」情報量可說是壓倒性的豐富，而且品質也相當優異。表面上發生的事件，其實是由在背後操控的另一群人所引起…等等，劇情中含有雙重甚至三重的陷阱，甚至還暗示著最後可能會讓福音戰士本身也感到畏懼的真相。這種「壓倒性的情報量」和「由謎題產生另一個謎題的構造」，完全顛覆了所有的預測，最後整體故事也漸漸開始醞釀出「神秘的世界觀」。
只要看過一次就無法逃離，「有趣到會讓人沉迷其中」的觀眾參與型作品。這就是「EVA」這部動畫！
